Les INU s’articulent autour de 30 sujets indicateurs répartis en six thèmes. Les sujets indicateurs permettent l’analyse et la surveillance de différents aspects de la nature urbaine. Grâce à la nature flexible des INU, et compte tenu des contraintes potentielles en termes de capacité, il est recommandé aux villes de mettre en œuvre au moins un sujet indicateur par thème.